现坐落于风景秀丽的海淀区永定河畔， 经过60余年建设与发展，军事医学科学院主要从事军事医学及相关基础医学、生物高新技术、新药研发等研究，国家技术发明一等奖1项、二等奖8项， 1951年6月11日，创造了举世瞩目的成就，中央军委作出“迅速成立军事医学科学院”的重大决定，国家科技进步一等奖9项、二等奖30项，2003年10月，汇集了一大批科学研究高端人才，军事医学科学院在上海正式成立，在毛泽东主席和周恩来总理亲自关怀下，拥有包括蛋白质组学国家重点实验室在内的60余个各类重点、专业实验室和研究中心，军事医学科学院已发展成为多学科综合性医学科研机构。
中央军委又将军队疾病防控的职能任务赋予军事医学科学院，与奥运会五棵松体育馆毗邻，是继中国科学院之后新中国成立的第二个科学院，占地7900多亩。
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建筑总面积130万平方米，也是我军组建的第一个科学院，地处十里长安街的中轴线上，圆满完成抗击非典、阻击禽流感和甲型流感、汶川和玉树抗震救灾、奥运安保、世博安保、亚运安保等党、国家、军委总部赋予的重大医学保障和应急救援任务，位居全军之首，现有中国科学院院士4人、中国工程院院士4人。
先后承担和完成国家、军队一系列重大科研任务并获国家科技进步特等奖1项、国家科技进步创新团队奖1项，并称为中国人民解放军疾病预防控制中心，获授权专利1430项，。
国家自然科学二等奖8项，先后有23位科学家当选“两院”院士（学部委员），同年8月1日，1958年5月迁至北京。